Os 20 confrontos serão disputados em jogo único, assim como os duelos da primeira fase. Não há, porém, vantagem do empate para o clube visitante. Os mandos de campo foram definidos por sorteio. Caso haja empate, a decisão vai para os pênaltis. As partidas serão disputadas entre os dias 7 e 16 de março.

Não há nenhum confronto entre dois times da Série A do Brasileirão. Os principais destaques são: Grêmio x Ferroviário-CE, Botafogo x Brasiliense, América-MG x Santa Cruz, Santos x Iguatu-CE e Vasco x ABC.

As equipes que avançarem à terceira fase da Copa do Brasil encontrarão os times que disputam a Libertadores: Flamengo, Palmeiras, Internacional, Fluminense, Corinthians, Athletico-PR, Atlético-MG e Fortaleza; o nono colocado da Série A de 2022 (São Paulo); o campeão da Série B (Cruzeiro); o campeão da Copa Verde (Paysandu); e o vice-campeão da Copa do Nordeste (Sport).

Confira todos os confrontos da 2ª fase da Copa do Brasil: (clubes à esquerda são mandantes):

Grêmio x Ferroviário-CE

Brasil-RS x Ponte Preta

Ituano x Ceará

CRB x Operário-MS

Botafogo x Brasiliense

Remo x São Luiz-RS

Águia de Marabá-PA x Goiás

CSA x Brusque

América-MG x Santa Cruz

Maringá-PR x Marcílio Dias-SC

Camboriú-SC x Bahia

Coritiba x Criciúma

Atlético-GO x Volta Redonda-RJ

Náutico x Vila Nova-GO

Ypiranga-RS x Red Bull Bragantino

Vasco x ABC

Santos x Iguatu-CE

Tombense x Retrô-PE

Botafogo-SP x São Raimundo-RR

Nova Iguaçu-RJ x Nova Mutum-MT