O Bayern, que busca o 12º título consecutivo do campeonato, foi superado pelo Leverkusen, que chegou a cinco pontos de vantagem na liderança após a vitória na BayArena.
Enquanto o Leverkusen continua invicto em 31 partidas em todas as competições nesta temporada, o Bayern já sofreu três derrotas na primeira divisão alemã e não conseguiu dar mais de um chute a gol contra a equipe de Xabi Alonso no fim de semana.
"O que estou sentindo falta é que, nos treinos, parecemos estar muito melhores, mais corajosos, porque estamos jogando com mais liberdade", disse Mueller à Sky Sport Germany.
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"Jogamos de A para B e depois para C sem nenhuma liberdade e ninguém realmente se arrisca. Hoje não estávamos lá. Perdemos por 3 a 0."
O atacante alemão de 34 anos disse que o técnico do Bayern, Thomas Tuchel, não pode ser culpado pela exibição da equipe.
"Havia jogadores de nível internacional suficientes em campo, então não há motivo para falar sobre o técnico", acrescentou Mueller.